國家「十五五」規劃提出鞏固提升粵港澳大灣區高質量發展動力源作用，並強化區域基礎設施互聯互通。皇崗口岸重建標誌着特區政府對接國家發展，亦是香港主動融入和服務國家發展大局的一項重點項目。特區政府上月公布的《香港第一個五年規劃》明確提出，發揮重建後皇崗口岸的優勢，實施「一地兩檢」及採用嶄新的「合作查驗、一次放行」通關模式。皇崗口岸正式開通，標誌着港深兩地在優化口岸布局、提升通關效率及便利人員往來方面取得重大成果。
李家超致辭時表示，皇崗口岸重建項目是港深兩地同心協力、共建共享的標誌性工程。口岸重建後正式開通，反映粵港澳大灣區互聯互通邁上新台階，是加快推進內地與香港基礎設施「硬聯通」、規則機制「軟聯通」和增進人民「心聯通」的生動實踐。
重建後的皇崗口岸定位為港深之間最重要的二十四小時客運陸路口岸，口岸的設計通關流量為每日二十萬人次，而在日後港鐵北環線支線開通後，更可提升至每日三十萬人次。在中央的支持下，皇崗口岸實施「一地兩檢」安排，設立清晰分界的港方口岸區及內地口岸區。皇崗口岸亦是港深兩地之間首個實施「合作查驗、一次放行」通關模式的陸路口岸，進一步提升旅客通關體驗和效率。在這嶄新的通關模式下，整體通關時間將由原來落馬洲／皇崗口岸約三十分鐘，大幅縮短至約五分鐘。
第十四屆全國人民代表大會常務委員會第二十三次會議於今年六月二十六日通過《全國人民代表大會常務委員會關於授權香港特別行政區對皇崗口岸港方口岸區及相關延伸區實施管轄的決定》，國務院其後於七月八日就啓用皇崗口岸港方口岸區及相關延伸區（港方口岸區）有關事項作出批覆，確定港方口岸區的具體坐標和面積，並同意港方口岸區由二○二六年七月三十一日零時起啓用並依照特區法律實施管轄。《皇崗口岸港方口岸區條例》（第659章）連同相關的附屬法例，已於七月三十一日生效。
自皇崗口岸港方口岸區於七月三十一日成立以來，特區政府一直全速推進口岸開通的各項籌備工作，包括進行不同規模的演練和測試，以及持續優化各項運作細節，為口岸正式開通作周全準備。港深雙方在確認口岸具備安全、暢順和高效運作的條件後，於十月九日作出聯合公布，宣布重建後的皇崗口岸定於二○二六年十月十二日上午六時三十分正式開通，提供二十四小時旅客及客運車輛通關服務。
出席開通儀式的特區政府官員包括政務司司長陳國基、財政司司長陳茂波、律政司司長林定國資深大律師、保安局局長鄧炳強、醫務衞生局局長盧寵茂教授、發展局局長甯漢豪、運輸及物流局局長陳美寶、政制及內地事務局局長謝小華、警務處處長周一鳴、入境事務處處長郭俊峯、海關關長陳子達和行政長官辦公室主任葉文娟等。
