為配合東涌綫延綫工程，港鐵東涌綫本星期六晚收車後，會進行軌道改道，當晚來往東涌及欣澳站的列車服務將提早約2小時完結，由東涌站開出的尾班車時間為晚上11時01分，由香港站開出的尾班車時間為11時07分，欣澳至香港站的列車服務維持正常。

港鐵會提供免費接駁巴士來往東涌及欣澳站，會在當晚安排約100名員工在場協助，亦會增設特別指示牌。至於星期日，東涌綫服務將回復正常。

港鐵機場鐵路總管呂幹貽說，接駁巴士最密3分鐘一班，車程預計要20至30分鐘，比平日長。他提醒乘客要留意接駁巴士開出的時間，如要趕搭欣澳至香港站的尾班列車，必須乘0時18分前由東涌站開出的接駁巴士往欣澳。

呂幹貽指出，港鐵今次為東涌延綫進行道岔安裝工序，會利用非行車時間完成，但如果遇上惡劣天氣，有機會影響進度，初步計劃工程會延後一星期，即於11月2日進行，港鐵會以工作團隊安全為優先考慮，亦會盡早通知乘客相關改動。他表示，道岔安裝工序複雜，港鐵未來3年將有3次類似工程。