審計報告早前發現，屯門至赤鱲角連接路工程造價超支19億元。立法會政府帳目委員會主席邵家輝表示，帳委會極度關注當局對項目的成本管控，雖然整體未超出立法會批出的撥款，但帳委會認為並不理想，促請政府工務部門在推展工程項目時，嚴格遵循工程項目原有的資源配置。

邵家輝說，帳委會亦極度關注政府對工程顧問和各承建商的監督，尤其在物料估算及擬備招標文件上的失誤而引致的額外支出，以及處理工地意外的不足。帳委會強烈促請政府探討在顧問合約中，適度地引入風險共同承擔的條款和補償事項機制，令顧問對工程的進度、成本控制和風險管理等負上一定責任。在推展工程項目時，部門如發現顧問涉及可能存在的專業疏忽或違反合約時，應主動徵詢法律意見並考慮展開索償，以保障政府權益。

他又表示，帳委會亦留意到顧問及承建商的一些表現，曾被評為「欠佳」甚至「極差」，但在現行工務工程的評標機制下，仍能在其後3年內取得政府工程合約。帳委會強烈認為當局有必要檢討現行評標機制，提高對投標者過往表現的評分比重，並考慮加入「黑名單」機制，以加強阻嚇力及促使利業提升服務質素。